Korarchaeia
Les Korarchaeota[1], Korarchaeia[2] (ou Xenarcheota) sont respectivement un phylum ou une classe d'archées thermophiles mis en évidence par l'analyse de séquences d'ARNr 16S à partir d'échantillons environnementaux provenant de sources chaudes du parc national de Yellowstone[3].
| Domaine | Archaea |
|---|---|
| Règne | Proteoarchaeati |
Barns et al., 1996
Rinke et al., 2021
- Korarchaeota
- Xenarchaeota
- Xenarchaea
Ordres de rang inférieur
Ces organismes se seraient différentiés assez tôt des Crenarchaeota et des Euryarchaeota, comme le suggèrent des études génétiques[1],[4]. Leur diversité phylogénétique semble avoir été sous-tendue par la dispersion géographique et les différences de températures et de salinité des milieux colonisés[5]. Ils ne sont jamais présents en abondance dans les milieux étudiés jusqu'à présent[5],[6].

Classification
modifierCette classe regroupe trois ordres et quatre genres :
- Candidatus Korarchaeales
- Candidatus Korarchaeum cryptofilum Elkins et al., 2008[7]
- Candidatus Methanodesulfokora washburnensis corrig. McKay et al., 2019
- Candidatus Njordarchaeales
- Candidatus Njordarchaeum guaymasense corrig. Xie et al., 2022
- Candidatus Panguiarchaeaceae
- Candidatus Panguiarchaeum symbiosum Qu et al., 2023
Cladogramme
modifierNotes et références
modifier- 1 2 S M Barns, C F Delwiche, J D Palmer et N R Pace, « Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences. », Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 93, no 17, , p. 9188–9193 (PMID 8799176, PMCID 38617, DOI 10.1073/pnas.93.17.9188, lire en ligne, consulté le )
- ↑ (en) « Class: Korarchaeia », sur lpsn.dsmz.de (consulté le )
- ↑ (en) Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron J. Mussig et Pierre-Alain Chaumeil, « A standardized archaeal taxonomy for the Genome Taxonomy Database », Nature Microbiology, vol. 6, no 7, , p. 946–959 (ISSN 2058-5276, DOI 10.1038/s41564-021-00918-8, lire en ligne, consulté le )
- ↑ (en) James G. Elkins, Mircea Podar, David E. Graham, Kira S. Makarova, Yuri Wolf, Lennart Randau, Brian P. Hedlund, Céline Brochier-Armanet, Victor Kunin, Iain Anderson, Alla Lapidus, Eugene Goltsman, Kerrie Barry, Eugene V. Koonin, Phil Hugenholtz, Nikos Kyrpides, Gerhard Wanner, Paul Richardson, Martin Keller et Karl O. Stetter, « A korarchaeal genome reveals insights into the evolution of the Archaea », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 105, no 23, , p. 8102-8107 (lire en ligne) DOI 10.1073/pnas.0801980105
- 1 2 3 (en) Thomas A. Auchtung, Galina Shyndriayeva et Colleen M. Cavanaugh, « 16S rRNA phylogenetic analysis and quantification of Korarchaeota indigenous to the hot springs of Kamchatka, Russia », Extremophiles, vol. 15, no 1, , p. 105-116 (lire en ligne) DOI 10.1007/s00792-010-0340-5
- ↑ (en) Laila Johanne Reigstad, Steffen Leth Jorgensen et Christa Schleper, « Diversity and abundance of Korarchaeota in terrestrial hot springs of Iceland and Kamchatka », The ISME Journal, vol. 4, no 3, , p. 346-356 (lire en ligne) DOI 10.1038/ismej.2009.126
- ↑ (en) NCBI : Candidatus Korarchaeum cryptofilum (taxons inclus)
- (en) Tree of Life Web Project : Korarchaeota
- (en) NCBI : Korarchaeota (taxons inclus)