Korarchaeia

phylum d'archées
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Les Korarchaeota[1], Korarchaeia[2] (ou Xenarcheota) sont respectivement un phylum ou une classe d'archées thermophiles mis en évidence par l'analyse de séquences d'ARNr 16S à partir d'échantillons environnementaux provenant de sources chaudes du parc national de Yellowstone[3].

Korarchaeota
Description de l'image Korarchaeota.jpg.
Classification
Domaine Archaea
Règne Proteoarchaeati

Phylum

Korarchaeota
Barns et al., 1996

Classe

Korarchaeia
Rinke et al., 2021

Synonymes

  • Korarchaeota
  • Xenarchaeota
  • Xenarchaea

Ordres de rang inférieur

Ces organismes se seraient différentiés assez tôt des Crenarchaeota et des Euryarchaeota, comme le suggèrent des études génétiques[1],[4]. Leur diversité phylogénétique semble avoir été sous-tendue par la dispersion géographique et les différences de températures et de salinité des milieux colonisés[5]. Ils ne sont jamais présents en abondance dans les milieux étudiés jusqu'à présent[5],[6].

Des Korarchaea ont été trouvées dans chacune des six sources chaudes (dans le sens des aiguilles d'une montre en partant d'en haut à gauche : Uzon4, Uzon7, Uzon8, Uzon9, Mut11, Mut13) étudiées dans le Kamtchatka[5].

Classification

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Cette classe regroupe trois ordres et quatre genres :

Cladogramme

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Notes et références

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  1. 1 2 S M Barns, C F Delwiche, J D Palmer et N R Pace, « Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences. », Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 93, no 17, , p. 9188–9193 (PMID 8799176, PMCID 38617, DOI 10.1073/pnas.93.17.9188, lire en ligne, consulté le )
  2. (en) « Class: Korarchaeia », sur lpsn.dsmz.de (consulté le )
  3. (en) Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron J. Mussig et Pierre-Alain Chaumeil, « A standardized archaeal taxonomy for the Genome Taxonomy Database », Nature Microbiology, vol. 6, no 7, , p. 946–959 (ISSN 2058-5276, DOI 10.1038/s41564-021-00918-8, lire en ligne, consulté le )
  4. (en) James G. Elkins, Mircea Podar, David E. Graham, Kira S. Makarova, Yuri Wolf, Lennart Randau, Brian P. Hedlund, Céline Brochier-Armanet, Victor Kunin, Iain Anderson, Alla Lapidus, Eugene Goltsman, Kerrie Barry, Eugene V. Koonin, Phil Hugenholtz, Nikos Kyrpides, Gerhard Wanner, Paul Richardson, Martin Keller et Karl O. Stetter, « A korarchaeal genome reveals insights into the evolution of the Archaea », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 105, no 23, , p. 8102-8107 (lire en ligne) DOI 10.1073/pnas.0801980105 PMID 18535141
  5. 1 2 3 (en) Thomas A. Auchtung, Galina Shyndriayeva et Colleen M. Cavanaugh, « 16S rRNA phylogenetic analysis and quantification of Korarchaeota indigenous to the hot springs of Kamchatka, Russia », Extremophiles, vol. 15, no 1, , p. 105-116 (lire en ligne) DOI 10.1007/s00792-010-0340-5 PMID 21153671
  6. (en) Laila Johanne Reigstad, Steffen Leth Jorgensen et Christa Schleper, « Diversity and abundance of Korarchaeota in terrestrial hot springs of Iceland and Kamchatka », The ISME Journal, vol. 4, no 3, , p. 346-356 (lire en ligne) DOI 10.1038/ismej.2009.126 PMID 19956276
  7. (en) NCBI : Candidatus Korarchaeum cryptofilum (taxons inclus)

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