TET1

TET1 (англ. Tet methylcytosine dioxygenase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 136 амінокислот, а молекулярна маса — 235 309.

TET1
Ідентифікатори
Символи	TET1, CXXC6, LCX, bA119F7.1, MLL-TET1-MLL, Tet methylcytosine dioxygenase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607790 MGI: 1098693 HomoloGene: 12735 GeneCards: TET1
Онтологія гена Молекулярна функція • iron ion binding • zinc ion binding • methylcytosine dioxygenase activity • dioxygenase activity • зв’язування з іоном металу • oxidoreductase activity • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of histone methylation • protein O-linked glycosylation • negative regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • transcription, DNA-templated • stem cell population maintenance • inner cell mass cell differentiation • positive regulation of cell population proliferation • DNA demethylation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • 5-methylcytosine catabolic process • oxidative demethylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80312	52463
Ensembl	ENSG00000138336	ENSMUSG00000047146
UniProt	Q8NFU7	Q3URK3
RefSeq (мРНК)	NM_030625	NM_001253857 NM_027384
RefSeq (білок)	NP_085128	NP_001240786 NP_001393310 NP_001393311 NP_001393312
Локус (UCSC)	Хр. 10: 68.56 – 68.69 Mb	Хр. 10: 62.64 – 62.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRSRHARPS		RLVRKEDVNK		KKKNSQLRKT		TKGANKNVAS		VKTLSPGKLK
QLIQERDVKK		KTEPKPPVPV		RSLLTRAGAA		RMNLDRTEVL		FQNPESLTCN
GFTMALRSTS		LSRRLSQPPL		VVAKSKKVPL		SKGLEKQHDC		DYKILPALGV
KHSENDSVPM		QDTQVLPDIE		TLIGVQNPSL		LKGKSQETTQ		FWSQRVEDSK
INIPTHSGPA		AEILPGPLEG		TRCGEGLFSE		ETLNDTSGSP		KMFAQDTVCA
PFPQRATPKV		TSQGNPSIQL		EELGSRVESL		KLSDSYLDPI		KSEHDCYPTS
SLNKVIPDLN		LRNCLALGGS		TSPTSVIKFL		LAGSKQATLG		AKPDHQEAFE
ATANQQEVSD		TTSFLGQAFG		AIPHQWELPG		ADPVHGEALG		ETPDLPEIPG
AIPVQGEVFG		TILDQQETLG		MSGSVVPDLP		VFLPVPPNPI		ATFNAPSKWP
EPQSTVSYGL		AVQGAIQILP		LGSGHTPQSS		SNSEKNSLPP		VMAISNVENE
KQVHISFLPA		NTQGFPLAPE		RGLFHASLGI		AQLSQAGPSK		SDRGSSQVSV
TSTVHVVNTT		VVTMPVPMVS		TSSSSYTTLL		PTLEKKKRKR		CGVCEPCQQK
TNCGECTYCK		NRKNSHQICK		KRKCEELKKK		PSVVVPLEVI		KENKRPQREK
KPKVLKADFD		NKPVNGPKSE		SMDYSRCGHG		EEQKLELNPH		TVENVTKNED
SMTGIEVEKW		TQNKKSQLTD		HVKGDFSANV		PEAEKSKNSE		VDKKRTKSPK
LFVQTVRNGI		KHVHCLPAET		NVSFKKFNIE		EFGKTLENNS		YKFLKDTANH
KNAMSSVATD		MSCDHLKGRS		NVLVFQQPGF		NCSSIPHSSH		SIINHHASIH
NEGDQPKTPE		NIPSKEPKDG		SPVQPSLLSL		MKDRRLTLEQ		VVAIEALTQL
SEAPSENSSP		SKSEKDEESE		QRTASLLNSC		KAILYTVRKD		LQDPNLQGEP
PKLNHCPSLE		KQSSCNTVVF		NGQTTTLSNS		HINSATNQAS		TKSHEYSKVT
NSLSLFIPKS		NSSKIDTNKS		IAQGIITLDN		CSNDLHQLPP		RNNEVEYCNQ
LLDSSKKLDS		DDLSCQDATH		TQIEEDVATQ		LTQLASIIKI		NYIKPEDKKV
ESTPTSLVTC		NVQQKYNQEK		GTIQQKPPSS		VHNNHGSSLT		KQKNPTQKKT
KSTPSRDRRK		KKPTVVSYQE		NDRQKWEKLS		YMYGTICDIW		IASKFQNFGQ
FCPHDFPTVF		GKISSSTKIW		KPLAQTRSIM		QPKTVFPPLT		QIKLQRYPES
AEEKVKVEPL		DSLSLFHLKT		ESNGKAFTDK		AYNSQVQLTV		NANQKAHPLT
QPSSPPNQCA		NVMAGDDQIR		FQQVVKEQLM		HQRLPTLPGI		SHETPLPESA
LTLRNVNVVC		SGGITVVSTK		SEEEVCSSSF		GTSEFSTVDS		AQKNFNDYAM
NFFTNPTKNL		VSITKDSELP		TCSCLDRVIQ		KDKGPYYTHL		GAGPSVAAVR
EIMENRYGQK		GNAIRIEIVV		YTGKEGKSSH		GCPIAKWVLR		RSSDEEKVLC
LVRQRTGHHC		PTAVMVVLIM		VWDGIPLPMA		DRLYTELTEN		LKSYNGHPTD
RRCTLNENRT		CTCQGIDPET		CGASFSFGCS		WSMYFNGCKF		GRSPSPRRFR
IDPSSPLHEK		NLEDNLQSLA		TRLAPIYKQY		APVAYQNQVE		YENVARECRL
GSKEGRPFSG		VTACLDFCAH		PHRDIHNMNN		GSTVVCTLTR		EDNRSLGVIP
QDEQLHVLPL		YKLSDTDEFG		SKEGMEAKIK		SGAIEVLAPR		RKKRTCFTQP
VPRSGKKRAA		MMTEVLAHKI		RAVEKKPIPR		IKRKNNSTTT		NNSKPSSLPT
LGSNTETVQP		EVKSETEPHF		ILKSSDNTKT		YSLMPSAPHP		VKEASPGFSW
SPKTASATPA		PLKNDATASC		GFSERSSTPH		CTMPSGRLSG		ANAAAADGPG
ISQLGEVAPL		PTLSAPVMEP		LINSEPSTGV		TEPLTPHQPN		HQPSFLTSPQ
DLASSPMEED		EQHSEADEPP		SDEPLSDDPL		SPAEEKLPHI		DEYWSDSEHI
FLDANIGGVA		IAPAHGSVLI		ECARRELHAT		TPVEHPNRNH		PTRLSLVFYQ
HKNLNKPQHG		FELNKIKFEA		KEAKNKKMKA		SEQKDQAANE		GPEQSSEVNE
LNQIPSHKAL		TLTHDNVVTV		SPYALTHVAG		PYNHWV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Kriaucionis S., Heintz N. (2009). The nuclear DNA base 5-hydroxymethylcytosine is present in Purkinje neurons and the brain. Science. 324: 929—930. PMID 19372393 doi:10.1126/science.1169786
• Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain. Cell. 145: 423—434. PMID 21496894 doi:10.1016/j.cell.2011.03.022

Див. також

• Хромосома 10