RXRB

RXRB (англ. Retinoid X receptor beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 533 амінокислот, а молекулярна маса — 56 922.

RXRB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1H9U, 1UHL, 5HJP, 5I4V
Ідентифікатори
Символи	RXRB, DAUDI6, H-2RIIBP, NR2B2, RCoR-1, Retinoid X receptor beta, RXRbeta, RXR-beta
Зовнішні ІД	OMIM: 180246 MGI: 98215 HomoloGene: 7923 GeneCards: RXRB
Реагує на сполуку
bexarotene
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • зв’язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • retinoic acid receptor signaling pathway • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • intracellular receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6257	20182
Ensembl	ENSG00000235712 ENSG00000231321 ENSG00000227322 ENSG00000204231 ENSG00000206289 ENSG00000228333	ENSMUSG00000039656
UniProt	P28702 Q5STP9	P28704
RefSeq (мРНК)	NM_001270401 NM_001291989 NM_021976	NM_001205214 NM_001205215 NM_001205216 NM_011306
RefSeq (білок)	NP_001257330 NP_001278918 NP_068811 NP_068811.1	NP_001192143 NP_001192144 NP_001192145 NP_035436
Локус (UCSC)	Хр. 6: 33.19 – 33.2 Mb	Хр. 17: 34.25 – 34.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSWAARPPFL		PQRHAAGQCG		PVGVRKEMHC		GVASRWRRRR		PWLDPAAAAA
AAVAGGEQQT		PEPEPGEAGR		DGMGDSGRDS		RSPDSSSPNP		LPQGVPPPSP
PGPPLPPSTA		PSLGGSGAPP		PPPMPPPPLG		SPFPVISSSM		GSPGLPPPAP
PGFSGPVSSP		QINSTVSLPG		GGSGPPEDVK		PPVLGVRGLH		CPPPPGGPGA
GKRLCAICGD		RSSGKHYGVY		SCEGCKGFFK		RTIRKDLTYS		CRDNKDCTVD
KRQRNRCQYC		RYQKCLATGM		KREAVQEERQ		RGKDKDGDGE		GAGGAPEEMP
VDRILEAELA		VEQKSDQGVE		GPGGTGGSGS		SPNDPVTNIC		QAADKQLFTL
VEWAKRIPHF		SSLPLDDQVI		LLRAGWNELL		IASFSHRSID		VRDGILLATG
LHVHRNSAHS		AGVGAIFDRV		LTELVSKMRD		MRMDKTELGC		LRAIILFNPD
AKGLSNPSEV		EVLREKVYAS		LETYCKQKYP		EQQGRFAKLL		LRLPALRSIG
LKCLEHLFFF		KLIGDTPIDT		FLMEMLEAPH		QLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Fleischhauer K., McBride O.W., DiSanto J.P., Ozato K., Yang S.Y. (1993). Cloning and chromosome mapping of human retinoid X receptor beta: selective amino acid sequence conservation of a nuclear hormone receptor in mammals. Hum. Genet. 90: 505—510. PMID 8381386 doi:10.1007/BF00217449

Див. також

• Хромосома 6