POLL

POLL (англ. DNA polymerase lambda) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 575 амінокислот, а молекулярна маса — 63 482.

POLL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1NZP, 1RZT, 1XSL, 1XSN, 1XSP, 2BCQ, 2BCR, 2BCS, 2BCU, 2BCV, 2GWS, 2JW5, 2PFN, 2PFO, 2PFP, 2PFQ, 3C5F, 3C5G, 3HW8, 3HWT, 3HX0, 3MDA, 3MDC, 3MGH, 3MGI, 3PML, 3PMN, 3PNC, 3UPQ, 3UQ0, 3UQ2, 4FO6, 4K4G, 4K4H, 4K4I, 4XA5, 4XUS, 4X5V, 5CR0, 4XQ8, 5CJ7, 5DKW, 5CP2, 5DDY, 5DDM, 5CB1, 5CWR, 4XRH, 5CHG, 5CA7
Ідентифікатори
Символи	POLL, BETAN, POLKAPPA, polymerase (DNA) lambda, DNA polymerase lambda
Зовнішні ІД	OMIM: 606343 MGI: 1889000 HomoloGene: 40863 GeneCards: POLL
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • DNA binding • nucleotidyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • lyase activity • DNA-directed DNA polymerase activity • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity • ДНК-полімераза • DNA polymerase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • реплікація ДНК • nucleotide-excision repair • somatic hypermutation of immunoglobulin genes • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК • double-strand break repair via homologous recombination • base-excision repair, gap-filling • double-strand break repair via nonhomologous end joining • DNA biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27343	56626
Ensembl	ENSG00000166169	ENSMUSG00000025218
UniProt	Q9UGP5	Q9QUG2 Q9QXE2
RefSeq (мРНК)	NM_001174084 NM_001174085 NM_001308382 NM_013274	NM_020032 NM_001330506 NM_001330507
RefSeq (білок)	NP_001167555 NP_001167556 NP_001295311 NP_037406	NP_001334531 NP_001334532 NP_001334533 NP_001334535 NP_036178 NP_001317435 NP_001317436 NP_064416
Локус (UCSC)	Хр. 10: 101.58 – 101.59 Mb	Хр. 19: 45.54 – 45.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPRGILKAF		PKRQKIHADA		SSKVLAKIPR		REEGEEAEEW		LSSLRAHVVR
TGIGRARAEL		FEKQIVQHGG		QLCPAQGPGV		THIVVDEGMD		YERALRLLRL
PQLPPGAQLV		KSAWLSLCLQ		ERRLVDVAGF		SIFIPSRYLD		HPQPSKAEQD
ASIPPGTHEA		LLQTALSPPP		PPTRPVSPPQ		KAKEAPNTQA		QPISDDEASD
GEETQVSAAD		LEALISGHYP		TSLEGDCEPS		PAPAVLDKWV		CAQPSSQKAT
NHNLHITEKL		EVLAKAYSVQ		GDKWRALGYA		KAINALKSFH		KPVTSYQEAC
SIPGIGKRMA		EKIIEILESG		HLRKLDHISE		SVPVLELFSN		IWGAGTKTAQ
MWYQQGFRSL		EDIRSQASLT		TQQAIGLKHY		SDFLERMPRE		EATEIEQTVQ
KAAQAFNSGL		LCVACGSYRR		GKATCGDVDV		LITHPDGRSH		RGIFSRLLDS
LRQEGFLTDD		LVSQEENGQQ		QKYLGVCRLP		GPGRRHRRLD		IIVVPYSEFA
CALLYFTGSA		HFNRSMRALA		KTKGMSLSEH		ALSTAVVRNT		HGCKVGPGRV
LPTPTEKDVF		RLLGLPYREP		AERDW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ліаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, синтез ДНК, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном марганцю. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Garcia-Diaz M., Bebenek K., Kunkel T.A., Blanco L. (2001). Identification of an intrinsic 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity in human DNA polymerase lambda: a possible role in base excision repair. J. Biol. Chem. 276: 34659—34663. PMID 11457865 doi:10.1074/jbc.M106336200
• Garcia-Diaz M., Bebenek K., Krahn J.M., Pedersen L.C., Kunkel T.A. (2007). Role of the catalytic metal during polymerization by DNA polymerase lambda. DNA Repair. 6: 1333—1340. PMID 17475573 doi:10.1016/j.dnarep.2007.03.005

Див. також

• Хромосома 10