NR1H3

NR1H3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1UHL, 3IPQ, 3IPS, 3IPU, 5AVI, 5AVL, 5HJS
Ідентифікатори
Символи	NR1H3, LXR-a, LXRA, RLD-1, Liver X receptor alpha, nuclear receptor subfamily 1 group H member 3
Зовнішні ІД	OMIM: 602423 MGI: 1352462 HomoloGene: 21165 GeneCards: NR1H3
Пов'язані генетичні захворювання
	метаболічні захворювання
Реагує на сполуку
	(25R)-cholest-5-ene-3β,26-diol, desmosterol
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cholesterol binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • zinc ion binding; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • sterol response element binding; • steroid hormone receptor activity; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor binding; • nuclear receptor coactivator activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• receptor complex; • нуклеоплазма; • RNA polymerase II transcription regulator complex; • клітинне ядро; • цитоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway; • sterol homeostasis; • negative regulation of pancreatic juice secretion; • negative regulation of inflammatory response; • cellular response to lipopolysaccharide; • negative regulation of lipid transport; • positive regulation of lipoprotein lipase activity; • lipid homeostasis; • triglyceride homeostasis; • negative regulation of macrophage activation; • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation; • positive regulation of cholesterol transport; • negative regulation of cholesterol storage; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of triglyceride biosynthetic process; • positive regulation of cholesterol efflux; • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process; • negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway; • regulation of circadian rhythm; • transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • response to progesterone; • steroid hormone mediated signaling pathway; • apoptotic cell clearance; • positive regulation of fatty acid biosynthetic process; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of secretion of lysosomal enzymes; • negative regulation of pinocytosis; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • intracellular receptor signaling pathway; • cholesterol homeostasis; • Обмін жирів; • multicellular organism development; • диференціація клітин; • negative regulation of cold-induced thermogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10062
	22259
	ENSG00000025434
	ENSMUSG00000002108
	Q13133
	Q9Z0Y9
	NM_001130101; NM_001130102; NM_001251934; NM_001251935; NM_005693
	NM_001177730; NM_013839; NM_001355279
NP_001123573; NP_001123574; NP_001238863; NP_001238864; NP_005684;
	NP_001350524; NP_005684.2
	NP_001171201; NP_038867; NP_001342208
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NR1H3 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group H member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 447 амінокислот, а молекулярна маса — 50 396^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLWLGAPVP	DIPPDSAVEL	WKPGAQDASS	QAQGGSSCIL	REEARMPHSA
GGTAGVGLEA	AEPTALLTRA	EPPSEPTEIR	PQKRKKGPAP	KMLGNELCSV
CGDKASGFHY	NVLSCEGCKG	FFRRSVIKGA	HYICHSGGHC	PMDTYMRRKC
QECRLRKCRQ	AGMREECVLS	EEQIRLKKLK	RQEEEQAHAT	SLPPRASSPP
QILPQLSPEQ	LGMIEKLVAA	QQQCNRRSFS	DRLRVTPWPM	APDPHSREAR
QQRFAHFTEL	AIVSVQEIVD	FAKQLPGFLQ	LSREDQIALL	KTSAIEVMLL
ETSRRYNPGS	ESITFLKDFS	YNREDFAKAG	LQVEFINPIF	EFSRAMNELQ
LNDAEFALLI	AISIFSADRP	NVQDQLQVER	LQHTYVEALH	AYVSIHHPHD
RLMFPRMLMK	LVSLRTLSSV	HSEQVFALRL	QDKKLPPLLS	EIWDVHE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NR1H3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Nuclear receptor subfamily 1 group H member 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7966 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13133 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з NR1H3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Nuclear receptor subfamily 1 group H member 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7966 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-6] UniProt, Q13133 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[5]