MS4A1

MS4A1 (англ. Membrane spanning 4-domains A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 297 амінокислот, а молекулярна маса — 33 077.

MS4A1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3PP4, 2OSL, 3BKY
Ідентифікатори
Символи	MS4A1, B1, Bp35, CD20, CVID5, LEU-16, MS4A2, S7, membrane spanning 4-domains A1, FMC7
Зовнішні ІД	OMIM: 112210 MGI: 88321 HomoloGene: 7259 GeneCards: MS4A1
Реагує на сполуку
Окрелізумаб
Онтологія гена Молекулярна функція • epidermal growth factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • MHC class II protein complex binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • екзосома • мембрана • external side of plasma membrane • міжклітинний простір • клітинне ядро Біологічний процес • B cell activation • B cell proliferation • humoral immune response • response to bacterium Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	931	12482
Ensembl	ENSG00000156738	ENSMUSG00000024673
UniProt	P11836	P19437
RefSeq (мРНК)	NM_152866 NM_021950 NM_152867	NM_007641
RefSeq (білок)	NP_068769 NP_690605 NP_690606	NP_031667
Локус (UCSC)	Хр. 11: 60.46 – 60.47 Mb	Хр. 19: 11.23 – 11.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTTPRNSVNG		TFPAEPMKGP		IAMQSGPKPL		FRRMSSLVGP		TQSFFMRESK
TLGAVQIMNG		LFHIALGGLL		MIPAGIYAPI		CVTVWYPLWG		GIMYIISGSL
LAATEKNSRK		CLVKGKMIMN		SLSLFAAISG		MILSIMDILN		IKISHFLKME
SLNFIRAHTP		YINIYNCEPA		NPSEKNSPST		QYCYSIQSLF		LGILSVMLIF
AFFQELVIAG		IVENEWKRTC		SRPKSNIVLL		SAEEKKEQTI		EIKEEVVGLT
ETSSQPKNEE		DIEIIPIQEE		EEEETETNFP		EPPQDQESSP		IENDSSP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Stamenkovic I., Seed B. (1988). Analysis of two cDNA clones encoding the B lymphocyte antigen CD20 (B1, Bp35), a type III integral membrane protein. J. Exp. Med. 167: 1975—1980. PMID 3260267 doi:10.1084/jem.167.6.1975
• Tedder T.F., Streuli M., Schlossman S.F., Saito H. (1988). Isolation and structure of a cDNA encoding the B1 (CD20) cell-surface antigen of human B lymphocytes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 208—212. PMID 2448768 doi:10.1073/pnas.85.1.208
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 doi:10.1021/pr800500r
• Einfeld D.A., Brown J.P., Valentine M.A., Clark E.A., Ledbetter J.A. (1988). Molecular cloning of the human B cell CD20 receptor predicts a hydrophobic protein with multiple transmembrane domains. EMBO J. 7: 711—717. PMID 2456210
• Tedder T.F., Klejman G., Schlossman S.F., Saito H. (1989). Structure of the gene encoding the human B lymphocyte differentiation antigen CD20 (B1). J. Immunol. 142: 2560—2568. PMID 2466899

Див. також

• Хромосома 11