IRF7

IRF7 (англ. Interferon regulatory factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 503 амінокислот, а молекулярна маса — 54 278.

IRF7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2O61
Ідентифікатори
Символи	IRF7, IRF-7H, IRF7A, IRF7B, IRF7C, IRF7H, IMD39, interferon regulatory factor 7, IRF-7
Зовнішні ІД	OMIM: 605047 MGI: 1859212 HomoloGene: 128624 GeneCards: IRF7
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • endosome membrane • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of interferon-alpha production • MDA-5 signaling pathway • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • regulation of adaptive immune response • response to virus • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of type I interferon production • cellular response to DNA damage stimulus • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • negative regulation of macrophage apoptotic process • type I interferon signaling pathway • immunoglobulin mediated immune response • establishment of viral latency • regulation of immune response • GO:0022415 viral process • regulation of monocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of interferon-beta production • interferon-beta production • regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of type I interferon production • вроджений імунітет • regulation of MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • interferon-alpha production • defense response to virus • регуляція експресії генів Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3665	54123
Ensembl	ENSG00000276561 ENSG00000185507	ENSMUSG00000025498
UniProt	Q92985	P70434
RefSeq (мРНК)	NM_001572 NM_004029 NM_004030 NM_004031	NM_001252600 NM_001252601 NM_016850
RefSeq (білок)	NP_001563 NP_004020 NP_004022	NP_001239529 NP_001239530 NP_058546
Локус (UCSC)	Хр. 11: 0.61 – 0.62 Mb	Хр. 7: 140.84 – 140.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALAPERAAP		RVLFGEWLLG		EISSGCYEGL		QWLDEARTCF		RVPWKHFARK
DLSEADARIF		KAWAVARGRW		PPSSRGGGPP		PEAETAERAG		WKTNFRCALR
STRRFVMLRD		NSGDPADPHK		VYALSRELCW		REGPGTDQTE		AEAPAAVPPP
QGGPPGPFLA		HTHAGLQAPG		PLPAPAGDKG		DLLLQAVQQS		CLADHLLTAS
WGADPVPTKA		PGEGQEGLPL		TGACAGGPGL		PAGELYGWAV		ETTPSPGPQP
AALTTGEAAA		PESPHQAEPY		LSPSPSACTA		VQEPSPGALD		VTIMYKGRTV
LQKVVGHPSC		TFLYGPPDPA		VRATDPQQVA		FPSPAELPDQ		KQLRYTEELL
RHVAPGLHLE		LRGPQLWARR		MGKCKVYWEV		GGPPGSASPS		TPACLLPRNC
DTPIFDFRVF		FQELVEFRAR		QRRGSPRYTI		YLGFGQDLSA		GRPKEKSLVL
VKLEPWLCRV		HLEGTQREGV		SSLDSSSLSL		CLSSANSLYD		DIECFLMELE
QPA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Zhang L., Pagano J.S. (1997). IRF-7, a new interferon regulatory factor associated with Epstein-Barr virus latency. Mol. Cell. Biol. 17: 5748—5757. PMID 9315633 doi:10.1128/MCB.17.10.5748
• Au W.-C., Moore P.A., LaFleur D.W., Tombal B., Pitha P.M. (1998). Characterization of the interferon regulatory factor-7 and its potential role in the transcription activation of interferon A genes. J. Biol. Chem. 273: 29210—29217. PMID 9786932 doi:10.1074/jbc.273.44.29210
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Marie I.J., Smith E., Prakash A., Levy D.E. (2000). Phosphorylation-induced dimerization of interferon regulatory factor 7 unmasks DNA binding and a bipartite transactivation domain. Mol. Cell. Biol. 20: 8803—8814. PMID 11073981 doi:10.1128/MCB.20.23.8803-8814.2000
• Smith E.J., Marie I.J., Prakash A., Garcia-Sastre A., Levy D.E. (2001). IRF3 and IRF7 phosphorylation in virus-infected cells does not require double-stranded RNA-dependent protein kinase R or Ikappa B kinase but is blocked by Vaccinia virus E3L protein. J. Biol. Chem. 276: 8951—8957. PMID 11124948 doi:10.1074/jbc.M008717200
• Zhang L., Pagano J.S. (2002). Structure and function of IRF-7. J. Interferon Cytokine Res. 22: 95—101. PMID 11846980 doi:10.1089/107999002753452700

Див. також

• Хромосома 11