CHTF18

CHTF18 (англ. Chromosome transmission fidelity factor 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 975 амінокислот, а молекулярна маса — 107 383.

CHTF18
Ідентифікатори
Символи	CHTF18, C16orf41, C321D2.2, C321D2.3, C321D2.4, CHL12, Ctf18, RUVBL, chromosome transmission fidelity factor 18
Зовнішні ІД	OMIM: 613201 MGI: 2384887 HomoloGene: 32532 GeneCards: CHTF18
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • DNA binding • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • DNA clamp loader activity Клітинна компонента • мембрана • Ctf18 RFC-like complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • реплікація ДНК • клітинний цикл • positive regulation of DNA-directed DNA polymerase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	63922	214901
Ensembl	ENSG00000127586	ENSMUSG00000019214
UniProt	Q8WVB6	Q8BIW9
RefSeq (мРНК)	NM_022092	NM_145409
RefSeq (білок)	NP_071375	NP_663384
Локус (UCSC)	Хр. 16: 0.79 – 0.8 Mb	Хр. 17: 25.94 – 25.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDYEQELCG		VEDDFHNQFA		AELEVLAELE		GASTPSPSGV		PLFTAGRPPR
TFEEALARGD		AASSPAPAAS		VGSSQGGARK		RQVDADLQPA		GSLPHAPRIK
RPRLQVVKRL		NFRSEEMEEP		PPPDSSPTDI		TPPPSPEDLA		ELWGHGVSEA
AADVGLTRAS		PAARNPVLRR		PPILEDYVHV		TSTEGVRAYL		VLRADPMAPG
VQGSLLHVPW		RGGGQLDLLG		VSLASLKKQV		DGERRERLLQ		EAQKLSDTLH
SLRSGEEEAA		QPLGAPEEEP		TDGQDASSHC		LWVDEFAPRH		YTELLSDDFT
NRCLLKWLKL		WDLVVFGHER		PSRKPRPSVE		PARVSKEATA		PGKWKSHEQV
LEEMLEAGLD		PSQRPKQKVA		LLCGPPGLGK		TTLAHVIARH		AGYSVVEMNA
SDDRSPEVFR		TRIEAATQME		SVLGAGGKPN		CLVIDEIDGA		PVAAINVLLS
ILNRKGPQEV		GPQGPAVPSG		GGRRRRAEGG		LLMRPIICIC		NDQFAPSLRQ
LKQQAFLLHF		PPTLPSRLVQ		RLQEVSLRQG		MRADPGVLAA		LCEKTDNDIR
ACINTLQFLY		SRGQRELSVR		DVQATRVGLK		DQRRGLFSVW		QEVFQLPRAQ
RRRVGQDPAL		PADTLLLGDG		DAGSLTSASQ		RFYRVLHAAA		SAGEHEKVVQ
GLFDNFLRLR		LRDSSLGAVC		VALDWLAFDD		LLAGAAHHSQ		SFQLLRYPPF
LPVAFHVLFA		SSHTPRITFP		SSQQEAQNRM		SQMRNLIQTL		VSGIAPATRS
RATPQALLLD		ALCLLLDILA		PKLRPVSTQL		YSTREKQQLA		SLVGTMLAYS
LTYRQERTPD		GQYIYRLEPN		VEELCRFPEL		PARKPLTYQT		KQLIAREIEV
EKMRRAEASA		RVENSPQVDG		SPPGLEGLLG		GIGEKGVHRP		APRNHEQRLE
HIMRRAAREE		QPEKDFFGRV		VVRSTAVPSA		GDTAPEQDSV		ERRMGTAVGR
SEVWFRFNEG		VSNAVRRSLY		IRDLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Merkle C.J., Karnitz L.M., Henry-Sanchez J.T., Chen J. (2003). Cloning and characterization of hCTF18, hCTF8, and hDCC1. Human homologs of a Saccharomyces cerevisiae complex involved in sister chromatid cohesion establishment. J. Biol. Chem. 278: 30051—30056. PMID 12766176 doi:10.1074/jbc.M211591200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
• Shiomi Y., Masutani C., Hanaoka F., Kimura H., Tsurimoto T. (2007). A second proliferating cell nuclear antigen loader complex, Ctf18-replication factor C, stimulates DNA polymerase eta activity. J. Biol. Chem. 282: 20906—20914. PMID 17545166 doi:10.1074/jbc.M610102200

Див. також

• Хромосома 16