CDH4

CDH4 (англ. Cadherin 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 916 амінокислот, а молекулярна маса — 100 281.

CDH4
Ідентифікатори
Символи	CDH4, CAD4, R-CAD, RCAD, cadherin 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603006 MGI: 99218 HomoloGene: 48044 GeneCards: CDH4
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв’язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • cell surface • catenin complex Біологічний процес • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адгезія клітин • positive regulation of axon extension • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • axon guidance • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1002	12561
Ensembl	ENSG00000280641 ENSG00000179242	ENSMUSG00000000305
UniProt	P55283	P39038
RefSeq (мРНК)	NM_001794 NM_001252338 NM_001252339	NM_009867 NM_001316723
RefSeq (білок)	NP_001239267 NP_001239268 NP_001785	NP_001303652 NP_033997
Локус (UCSC)	Хр. 20: 61.25 – 61.94 Mb	Хр. 2: 179.08 – 179.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTAGAGVLLL		LLSLSGALRA		HNEDLTTRET		CKAGFSEDDY		TALISQNILE
GEKLLQVKFS		SCVGTKGTQY		ETNSMDFKVG		ADGTVFATRE		LQVPSEQVAF
TVTAWDSQTA		EKWDAVVRLL		VAQTSSPHSG		HKPQKGKKVV		ALDPSPPPKD
TLLPWPQHQN		ANGLRRRKRD		WVIPPINVPE		NSRGPFPQQL		VRIRSDKDND
IPIRYSITGV		GADQPPMEVF		SIDSMSGRMY		VTRPMDREEH		ASYHLRAHAV
DMNGNKVENP		IDLYIYVIDM		NDNRPEFINQ		VYNGSVDEGS		KPGTYVMTVT
ANDADDSTTA		NGMVRYRIVT		QTPQSPSQNM		FTINSETGDI		VTVAAGLDRE
KVQQYTVIVQ		ATDMEGNLNY		GLSNTATAII		TVTDVNDNPP		EFTASTFAGE
VPENRVETVV		ANLTVMDRDQ		PHSPNWNAVY		RIISGDPSGH		FSVRTDPVTN
EGMVTVVKAV		DYELNRAFML		TVMVSNQAPL		ASGIQMSFQS		TAGVTISIMD
INEAPYFPSN		HKLIRLEEGV		PPGTVLTTFS		AVDPDRFMQQ		AVRYSKLSDP
ASWLHINATN		GQITTAAVLD		RESLYTKNNV		YEATFLAADN		GIPPASGTGT
LQIYLIDIND		NAPELLPKEA		QICEKPNLNA		INITAADADV		DPNIGPYVFE
LPFVPAAVRK		NWTITRLNGD		YAQLSLRILY		LEAGMYDVPI		IVTDSGNPPL
SNTSIIKVKV		CPCDDNGDCT		TIGAVAAAGL		GTGAIVAILI		CILILLTMVL
LFVMWMKRRE		KERHTKQLLI		DPEDDVRDNI		LKYDEEGGGE		EDQDYDLSQL
QQPEAMGHVP		SKAPGVRRVD		ERPVGAEPQY		PIRPMVPHPG		DIGDFINEGL
RAADNDPTAP		PYDSLLVFDY		EGSGSTAGSV		SSLNSSSSGD		QDYDYLNDWG
PRFKKLADMY		GGGEED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033
• Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Див. також

• Хромосома 20