La protocooperazione in ecologia è un'interazione biologica di tipo mutualistico nella quale due organismi o popolazioni beneficiano mutuamente (+/+), ma questa condizione non è essenziale per la vita di entrambi, poiché possono vivere anche separati. Questa interazione può accadere perfino fra differenti regni come è il caso degli animali impollinatori. Tra questi troviamo insetti (soprattutto imenotteri e ditteri), uccelli e pipistrelli, che permettono la riproduzione delle angiosperme. Gli animali ci guadagnano nutrimento, mentre la pianta ci guadagna l'impollinazione. Abbiamo anche la dispersione di sementi, grazie ad esempio alla volpe volante.

Un esempio di protocooperazione: l'interazione mutualistica tra l'ape europea (Apis mellifera) e il cardo campestre (Cirsium arvense)

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